Función pairs en R

La función pairs

En R base puedes crear un gráfico de correlación de múltiples variables (por pares) con la función pairs. Ten en cuenta que utilizar esta función es equivalente a pasar un data frame numérico a la función plot.

# Variables numéricas
df <- iris[1:4]

pairs(df)

# Equivalente a:
pairs(~ Sepal.Length + Sepal.Width +
        Petal.Length + Petal.Width, data = df)

# Equivalente a:
with(df, pairs(~ Sepal.Length + Sepal.Width +
                 Petal.Length + Petal.Width))

# Equivalente a:
plot(df)

Función pairs en R

Existen varios argumentos que se pueden utilizar para personalizar la salida. El siguiente bloque de código resalta y describe algunos de los argumentos más relevantes. Escribe ?pairs para obtener la lista completa.

# Variables numéricas
df <- iris[1:4]

pairs(df,       # Datos
      pch = 19, # Símbolo pch
      col = 4,  # Color
      main = "Title",    # Título
      gap = 0,           # Distancia entre gráficos
      row1attop = FALSE, # Dirección de la diagonal
      labels = colnames(df), # Etiquetas
      cex.labels = 0.8,  # Tamaño textos diagonales
      font.labels = 1)   # Fuente textos diagonales

Argumentos de la función pairs

Colores por grupo

Colores por grupo en la función pairs

El esquema de color se puede personalizar de tal modo que cada grupo de tu conjunto de datos se coloree de un color diferente. Para tal propósito puedes indexar tu variable categórica a una paleta de colores. Revisa la lista de paletas de colores o crea la tuya propia.

# Variables numéricas
df <- iris[1:4]

# Grupos
especies <- iris[, 5]

# Número de grupos
l <- length(unique(especies))

pairs(df, col = hcl.colors(l, "Temps")[especies])

Función pairs símbolos pch

Ten en cuenta que algunos símbolos pch permiten establecer el color de fondo y el borde como en el siguiente ejemplo.

# Variables numéricas
df <- iris[1:4]

# Grupos
especies <- iris[, 5]

# Número de grupos
l <- length(unique(especies))

pairs(df,
      pch = 22,
      bg = hcl.colors(l, "Temps")[especies],
      col = hcl.colors(l, "Temps")[especies])
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